Niewielka podtoruńska miejscowość Czarne Błoto została wzmiankowana po raz pierwszy w 1596 r. jako niemieckie Schwarze Bruch przy okazji przekazania tych terenów kolonistom z pobliskiej miejscowości Górsk. Zadaniem kolonistów z Górska było wykarczowanie i osuszenie terenu bez prawa stawiania tam budynków. Zakaz został w późniejszym czasie złamany a w 1732 roku rada miasta Torunia założyła tam wieś. W 1820 roku dotychczasowe wioski należące do Torunia: Czarne Błota, Nowe Błota oraz Ziegelwiese połączono w jedną miejscowość - Czarne Błoto.
Jeżeli ktoś zapuści się w tamte strony to zachęcam do odwiedzenia starego ewangielickiego cmentarza, który to od czasu pierwszej wojny światowej jest nieużywany, zapomniany i powoli porasta lasem. Cmentarz leży nieopodal głównej drogi biegnącej przez miejscowość stanowi też najciekawszy obiekt w wiosce. Na cmetarzu warto zwrócić uwagę na figurkę Pana Jezusa na krzyżu przybitą do drzewa i nagrobki w kształcie drewnianych pieńków.