Stacja powstała w 1912 roku jako Bielitz Niederstadt. Od 1925 do 1951 nosiła nazwę Biała Lipnik. Pierwotny budynek stacyjny zbudowany był z muru pruskiego, ale został rozebrany w latach 80. XX wieku, ponieważ groził katastrofą budowlaną.
Podczas remontu stacji zlikwidowano wyjście (południowa strona stacji) w kierunku ul. Sempołowskiej, "dzikie" przejście na południowych krańcach peronów oraz charakterystyczne wiaty - które zastąpiono miniaturowymi przystankami (zbyt małymi dla Lipnika).
Z Lipnika odchodziła bocznica do zakładów tłuszczowych Bielmar, dziś już zlikwidowana.
Od czerwca 2008 roku, przez pewien czas, istniała tu galeria sztuki Na Stacji, założona przez Fundację Rozwoju Miasta Bielska-Białej. Na peronach zostały zamontowane stałe elementy wystawiennicze, na których na co dzień były eksponowane kopie arcydzieł światowego malarstwa, a w weekendy prace lokalnych artystów i osób.