Do czasu ukonstytuowania się niezależnej gminy żydowskiej w Bodzentynie, wyznawcy judaizmu z tego miasta chowali swoich zmarłych w Szydłowcu. W 1866 roku zakupiono plac z przeznaczeniem na cmentarz. Wyznaczony plac, tzw. Krakowiec, stanowił własność kościoła katolickiego i już od kilkunastu lat był wykorzystywany przez społeczność starozakonnych dla celów grzebalnych. Został nieodpłatnie przekazany przez władze gminie żydowskiej. Na początku XX wieku kirkut był ogrodzony. W 1933 dokupiono pole w celu powiększenia cmentarza. Po likwidacji bodzentyńskiego getta Niemcy częściowo zdewastowali kirkut. Ostatni pochówek odbył się w 1942. Na obszarze 2 ha zachowało się około 55 macew postawionych w latach 1870–1934. Większość ocalałych płyt posiada czytelne inskrypcje hebrajskie oraz bogate zdobienia. Cmentarz zamknięto dla celów grzebalnych w 1964r. W pierwszej dekadzie XXI wieku cmentarz został uporządkowany i odrestaurowany.
Na cmentarzu spoczywa Dorota z Bryczkowskich Herling-Grudzińska – matka pisarza Gustawa Herlinga-Grudzińskiego
Kirkut w Bodzentynie wskazywała skrzynka marveta OP6407 założona 09.04.2013 i zarchiwizowana w dniu 25.11.2014