Synagoga została zbudowana w latach 1882-1883 (teren pod budowę na ówczesnym Glasserplatz - dziś Plac Powstańców Wlkp. - zakupiono za 1.500marek), według projektu Gidona Weinerta. Uroczyście otwarta 19 kwietnia 1883 roku. Budynek z surowej cegły był budowlą centralną z dobudowaną do niej absydą. Główne pomieszczenie miało wymiary 13,8 x 12,8 m i oferowało 350 miejsc siedzących. Całość sprawiała wrażenie dłuższego niż była w rzeczywistości. Wysokość pomieszczenia wynosiła 10 m, a wysokość zewnętrzna budynku, aż do gwiazdy na ukoronowaniu światła górnego, to 16,6 m. Pomieszczenie oświetlały dwa potężne żyrandole w kształcie korony, oraz kinkiety gazowe. Synagoga posiadała w swym wnętrzu organy, organista natomiast zwrócony był do wspólnoty twarzą, a nie plecami.

Podczas nocy kryształowej z 9 na 10 listopada 1938 roku, bojówki hitlerowskie spaliły synagogę. Po spaleniu jej mury zostały rozebrane, a grunt o powierzchni 120 m ² odkupiło miasto za 2000 marek. Umowę kupna-sprzedaży podpisał w 1941 r. ostatni przewodniczący zielonogórskiej gminy żydowskiej Alfred Selowsky i dr Alfred Laskau, syn poprzedniego przewodniczącego gminy. W późniejszym czasie na miejscu po synagodze wybudowano zbiornik przeciwpożarowy. Po zasypaniu zbiornika w latach 60-tych XX w. postawiono w tym miejscu sklep spożywczy, znany jako „dom chleba”, który spłonął w latach 70-tych XX w. Obecnie na miejscu synagogi wznosi się nowy budynek Filharmonii Zielonogórskiej.  Jedyną pamiątką po zielonogórskiej synagodze jest karafka z napisem „Synagoge Grünberg” i gwiazdą Dawida (odnaleziona w Niemczech). Znajduje się ona w siedzibie Lubuskiej Fundacji Judaica (LFJ).

9 listopada 2008 roku na miejscu, gdzie stała synagoga został odsłonięty obelisk upamiętniający jej zniszczenie podczas nocy kryształowej. Został ufundowany przez LFJ. W uroczystości wzięli udział przedstawiciele gmin żydowskich z Polski, Niemiec i Izraela oraz rabin Walter Rothschild z Berlina. Na obelisku widnieje napis: "W tym miejscu stała synagoga zniszczona przez nazistów 9/10 X 1938".

Opis kesza: mikrotutka znajduje się w oczywistym miejscu po prawej od pomnika (stojąc na wprost).
Miejsce BARDZO ruchliwe praktycznie przez całą dobę (plus obserwatorzy z przystanku MZK po drugiej stronie ulicy) - dlatego zalecam poszukiwania póżnym wieczorem lub nocą (najlepiej podejmowac na "grzebanie w plecaku" ;))